從中央紀委國家監委獲悉，吉林長春長生公司問題疫苗案件發生后，黨中央高度重視，國務院派出專門調查組對事件進行了全面調查，中央紀委國家監委開展了監管責任調查和審查調查工作，對6名中管干部作出予以免職、責令辭職、要求引咎辭職等處理，對涉嫌職務犯罪的原國家食品藥品監督管理總局黨組成員、副局長吳湞給予開除黨籍處分并移送檢察機關依法審查起訴。
同時，有關部門和地方根據調查認定事實，依規依紀依法對涉及原國家食品藥品監管總局、國家藥監局、吉林省各級藥品監管部門、長春市人民政府、長春市高新技術產業開發區管委會等42名非中管干部進行了嚴肅處理，其中，廳局級干部13人、縣處級干部23人、鄉科級及以下干部6人，對涉嫌職務犯罪的原吉林省食品藥品監管局3名責任人給予開除黨籍處分并移送檢察機關依法審查起訴，對包括原國家食品藥品監管總局藥品化妝品監管司1名副司長、原吉林省食品藥品監管局兩名副局長在內的6名責任人給予留黨察看或撤銷黨內職務、政務撤職處分，對29名責任人給予其他黨紀政務處分。